鸢算科技：多软件实例补充第一批（2026-10-27）

参考计算：20个GPUMD（每种4个初速度种子），8个LAMMPS反向NEMD，8个GROMACS NVE小例；工具转换和分析输入位于tools。HNEMD 1ns与EMD 10–30ps窗口不是已收敛材料热导率。

python analyze.py：重新提取参考热输运数值。
python plot.py：重新绘制6张结构/数据图。
python start.py：按菜单生成工作目录和提交脚本，检查后 bash submit.sh。
python analyze.py --root work：提取自己已完成的热输运目录。

GPUMD 5.9.1、LAMMPS 30Sep2026、GROMACS 2026.4；GPU模板使用P100核时分区，可按所用资源改为对应模块与分区，不使用管理节点运行模拟。GROMACS模型为SPC/E刚性水，不包含真实分子内振动谱。势文件来自GPUMD官方发行版Si_Fan_2019.txt，许可证见LICENSES；原始上游作品版权归作者。其余结构、处理和绘图由本批生成。
共享GROMACS水轨迹来自此前已完成的water-300实例，工具命令见官网教程。输入/参考结果不包含VASP授权文件、用户数据或管理配置。
