VASPKIT专题

VASPKIT:晶体与分子对称性

空间群依赖晶胞、原点和容差。先识别对称性,再决定是否转换原胞或常规胞;磁性、缺陷和有意施加的应变不应盲目对称化。

更新于 2026-10-26约 6 分钟阅读按任务与环境选择适用配置
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空间群依赖晶胞、原点和容差。先识别对称性,再决定是否转换原胞或常规胞;磁性、缺陷和有意施加的应变不应盲目对称化。

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先准备示例#

下载输入、后处理数据与绘图脚本,解压后进入目录:

unzip vaspkit-examples-*.zip
cd vaspkit-examples
python3 prepare.py
module load vaspkit/1.5.1

prepare.py从集群安装的官方examples复制需要的原始示例;附件本身不转发这些分发文件。每个功能的目录独立,下面的cd cases/...均从附件根目录开始。完成一个功能后可用cd ../..回到根目录。

主要例子的文件#

安装包示例 seek_kpath/GaAs_bulk,在集群重新执行本功能;不是本轮重新进行全部上游VASP计算。

完整的配套文件通过附件和prepare.py准备。若本功能需要WAVECAR/WAVEDER,先按新计算与波函数准备运行自己的VASP,不使用其他体系的波函数代替。

各功能操作#

601 · 晶体对称性#

按下面顺序输入;原子编号从1开始,元素名与当前POSCAR一致。更换体系时先核对所需的文件和编号。

实例来源:安装包示例 seek_kpath/GaAs_bulk,在集群重新执行本功能;不是本轮重新进行全部上游VASP计算。

在附件根目录执行:

cd cases/601
vaspkit < answers.in

answers.in实际内容如下,每行对应一次输入;也可运行vaspkit后逐行手动键入。

601

目录中的主要配套文件:KPATH.in、POSCAR。

本例输出摘要(数值仅对应上述输入):

Total Atoms:   8
Full Formula Unit: As4Ga4
Crystal Class: -43m
Lattice Constants:  5.654  5.654  5.654
Lattice Angles:  90.00  90.00  90.00
Volume:  180.717
Density (g/cm3):  5.316
Space Group Number: 216
Point Group: 31 [ Td ]
International: F-43m
Symmetry Operations:  96
Symmetry Accuracy: 1.0E-05

602 · 寻找原胞#

按下面顺序输入;原子编号从1开始,元素名与当前POSCAR一致。更换体系时先核对所需的文件和编号。

实例来源:安装包示例 seek_kpath/GaAs_bulk,在集群重新执行本功能;不是本轮重新进行全部上游VASP计算。

在附件根目录执行:

cd cases/602
vaspkit < answers.in

answers.in实际内容如下,每行对应一次输入;也可运行vaspkit后逐行手动键入。

602

目录中的主要配套文件:KPATH.in、POSCAR。

本次得到:PRIMCELL.vasp。原始输入与结果保持在同一例子目录;表格文件先查看首行列名,再选择横纵轴。

本例输出摘要(数值仅对应上述输入):

Total Atoms in Primitive Cell:   2
Lattice Constants in Primitive Cell:   3.998   3.998   3.998
Lattice Angles in Primitive Cell:  60.000  60.000  60.000
Crystal Class: -43m
Space Group Number: 216
Point Group: 31 [ Td ]
International: F-43m
Symmetry Operations:  96

603 · 寻找常规胞#

按下面顺序输入;原子编号从1开始,元素名与当前POSCAR一致。更换体系时先核对所需的文件和编号。

实例来源:安装包示例 seek_kpath/GaAs_bulk,在集群重新执行本功能;不是本轮重新进行全部上游VASP计算。

在附件根目录执行:

cd cases/603
vaspkit < answers.in

answers.in实际内容如下,每行对应一次输入;也可运行vaspkit后逐行手动键入。

603

目录中的主要配套文件:KPATH.in、POSCAR。

本次得到:CONVCELL.vasp。原始输入与结果保持在同一例子目录;表格文件先查看首行列名,再选择横纵轴。

本例输出摘要(数值仅对应上述输入):

Lattice Constants in Conventional Cell:   5.469   5.469   5.469
Lattice Angles in Conventional Cell:  90.000  90.000  90.000
Crystal Class: m-3m
Space Group Number: 227
Point Group: 32 [ Oh ]
International: Fd-3m
Symmetry Operations:  48

604 · 等价原子#

按下面顺序输入;原子编号从1开始,元素名与当前POSCAR一致。更换体系时先核对所需的文件和编号。

实例来源:安装包示例 seek_kpath/GaAs_bulk,在集群重新执行本功能;不是本轮重新进行全部上游VASP计算。

在附件根目录执行:

cd cases/604
vaspkit < answers.in

answers.in实际内容如下,每行对应一次输入;也可运行vaspkit后逐行手动键入。

604

目录中的主要配套文件:KPATH.in、POSCAR。

本例输出摘要(数值仅对应上述输入):

Full Formula Unit: As4Ga4
Total Atoms:   8
Lattice Constants:  5.654  5.654  5.654
Lattice Angles:  90.00  90.00  90.00
Space Group Number: 216
International: F-43m
Symmetry Operations:  96
Symmetry Accuracy: 1.0E-05
Non-Equivalent Atoms: [As]  1
Non-Equivalent Atoms: [Ga]  1

608 · 优化结构对称性#

按下面顺序输入;原子编号从1开始,元素名与当前POSCAR一致。更换体系时先核对所需的文件和编号。

实例来源:安装包示例 seek_kpath/GaAs_bulk,在集群重新执行本功能;不是本轮重新进行全部上游VASP计算。

在附件根目录执行:

cd cases/608
vaspkit < answers.in

answers.in实际内容如下,每行对应一次输入;也可运行vaspkit后逐行手动键入。

608

目录中的主要配套文件:KPATH.in、POSCAR。

本例输出摘要(数值仅对应上述输入):

Total Atoms:   8
Full Formula Unit: As4Ga4
Crystal Class: -43m
Lattice Constants:  5.654  5.654  5.654
Lattice Angles:  90.00  90.00  90.00
Volume:  180.717
Density (g/cm3):  5.316
Space Group Number: 216
Point Group: 31 [ Td ]
International: F-43m
Symmetry Operations:  96
Symmetry Accuracy: 1.0E-05

609 · 分子点群#

按下面顺序输入;原子编号从1开始,元素名与当前POSCAR一致。更换体系时先核对所需的文件和编号。

实例来源:安装包示例 thermo_correction/ethanol,在集群重新执行本功能;不是本轮重新进行全部上游VASP计算。

在附件根目录执行:

cd cases/609
vaspkit < answers.in

answers.in实际内容如下,每行对应一次输入;也可运行vaspkit后逐行手动键入。

609

目录中的主要配套文件:CONTCAR、INCAR、KPOINTS、OUTCAR、POSCAR。

本例输出摘要(数值仅对应上述输入):

Prototype: AB2C6
Total Atoms:   9

换成自己的体系#

先复制一份计算目录,确认POSCAR、INCAR、KPOINTS和各结果来自同一计算,再运行所需菜单。涉及静态、优化或声子等前置VASP任务,先完成计算再后处理;VASPKIT不会替代这些计算。保留结构、输入参数、工具版本和提取后的数据,后续改图时不必反复重算。

方法参考:VASPKIT官方教程;菜单与交互输入以本专题实际使用的安装版本为准。使用结果开展研究时引用VASPKIT论文。

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