ABACUS Kubo–Greenwood电子输运
Kubo–Greenwood电子输运：终端操作、完整输入、真实结果与适用范围。
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本篇采用鸢算科技集群 ABACUS 3.10.1 的实际输入与输出。下载实操资料包，解压后进入 abacus-examples。inputs 是干净输入，cases 是参考结果，work 用于你的新计算。
这篇要做什么#
从有限温度电子结构计算频率相关的电导与电子热导。本例使用较少k点、有限空带和展宽，只展示Kubo–Greenwood输出与绘图；不能把首个频率点直接作为收敛直流电导。电子热导不同于声子晶格热导，不能替代ShengBTE的声子散射计算。
1 准备并提交#
python new-case.py electronic-conductivity
cd work/electronic-conductivity
sbatch run.sh
提交脚本使用核时分区模板。套餐用户按自己的资源权限用 yskit 生成提交脚本，保留相同的 ABACUS 计算命令。不要在登录节点直接运行计算。
本篇资料目录：electronic-conductivity。其他对照例回到资料包根目录，换目录名后用同样三个命令提交。
2 核心输入#
electronic-conductivity/INPUT 的完整内容：
INPUT_PARAMETERS
suffix tutorial
calculation scf
basis_type pw
ecutwfc 40
scf_thr 1e-8
scf_nmax 150
ks_solver cg
device cpu
precision double
cal_force 1
cal_stress 1
pseudo_dir ../../PP_ORB
orbital_dir ../../PP_ORB
out_chg 1
out_pot 1
out_wfc_pw 1
cal_cond 1
nbands 24
smearing_method fd
smearing_sigma 0.1
cond_dw 0.2
cond_wcut 8
cond_fwhm 0.5
重点检查：cal_cond、nbands、smearing_sigma、cond_dw、cond_wcut、cond_fwhm。参数与说明应按3.10.1理解；官网 latest 的新增参数见版本与扩展范围。
展开完整 STRU 结构与 KPT 采样文件
STRU#
ATOMIC_SPECIES
Si 28.0855 Si_ONCV_PBE-1.0.upf
NUMERICAL_ORBITAL
Si_gga_8au_100Ry_2s2p1d.orb
LATTICE_CONSTANT
10.26
LATTICE_VECTORS
0 0.5 0.5
0.5 0 0.5
0.5 0.5 0
ATOMIC_POSITIONS
Direct
Si
0.0
2
0 0 0 1 1 1
0.25 0.25 0.25 1 1 1
KPT#
K_POINTS
0
Gamma
2 2 2 0 0 0
3 检查输出和实际结果#
squeue -u "$USER"
tail -n 30 stdout.log
ls OUT.*
确认正常结束后，再检查电子收敛、几何或时间步终止条件以及本篇需要的结果文件。SCF电子收敛不等于晶胞或原子优化完成。
| 实算目录 | 最后总能量 / eV | 计算类型 | 执行路径 |
|---|---|---|---|
electronic-conductivity |
-215.606080766 | scf |
CPU |
总能量是整个输入晶胞的量；不同原子数、赝势、泛函或物理条件的数值不能直接相减。CPU路径也在分配的计算资源中执行，本表不提供CPU节点性能对照。
4 提取和重画#
回到资料包根目录：
module load ase/3.29.0
python plot.py conductivity
ls figures
plot.py读取对应原始日志或结果文件；已有CSV在 analysis。结构可打开输出的 STRU.cif，cube可在VESTA查看。保留原始数据、坐标单位和参数，修改绘图不能改变计算结果。