ABACUS 专题

ABACUS 随机DFT与高温电子

随机DFT与高温电子:终端操作、完整输入、真实结果与适用范围。

更新于 2026-10-27约 3 分钟阅读按任务与环境选择适用配置
阅读本篇目录

本篇采用鸢算科技集群 ABACUS 3.10.1 的实际输入与输出。下载实操资料包,解压后进入 abacus-examples。inputs 是干净输入,cases 是参考结果,work 用于你的新计算。

这篇要做什么#

随机DFT通过随机轨道与Chebyshev展开估计电子态。本例使用较高电子展宽,不能和普通低温DFT总能量直接当成同一条件对照。nbands_sto、nche_sto和随机种子需要独立检查;正式统计误差要从多个独立种子获得,单次运行没有误差条。

1 准备并提交#

python new-case.py official-stochastic-pw_Si2
cd work/official-stochastic-pw_Si2
sbatch run.sh

提交脚本使用核时分区模板。套餐用户按自己的资源权限用 yskit 生成提交脚本,保留相同的 ABACUS 计算命令。不要在登录节点直接运行计算。

本篇资料目录:official-stochastic-pw_Si2。其他对照例回到资料包根目录,换目录名后用同样三个命令提交。

2 核心输入#

official-stochastic-pw_Si2/INPUT 的完整内容:

INPUT_PARAMETERS
calculation scf
esolver_type sdft
pseudo_dir ../../PP_ORB
nbands 4
nbands_sto 64
nche_sto 100
method_sto 1
ecutwfc 60
scf_nmax 150
symmetry 1
smearing_method fd
smearing_sigma 0.6
orbital_dir ../../PP_ORB
device gpu
ks_solver cg

重点检查:esolver_type、nbands_sto、nche_sto、smearing_sigma。参数与说明应按3.10.1理解;官网 latest 的新增参数见版本与扩展范围。

展开完整 STRU 结构与 KPT 采样文件

STRU#

#This is the atom file containing all the information
#about the lattice structure.

ATOMIC_SPECIES
Si 1.000 Si.pz-vbc.UPF 	#Element, Mass, Pseudopotential

LATTICE_CONSTANT
10.2  			#Lattice constant

LATTICE_VECTORS
0.5 0.5 0.0 		#Lattice vector 1
0.5 0.0 0.5 		#Lattice vector 2
0.0 0.5 0.5 		#Lattice vector 3

ATOMIC_POSITIONS
Cartesian 		#Cartesian(Unit is LATTICE_CONSTANT)
Si 			#Name of element	
0.0			#Magnetic for this element.
2			#Number of atoms
0.00 0.00 0.00 1 1 1
0.25 0.25 0.25 1 1 1

KPT#

K_POINTS
0
Gamma
2 2 2 0 0 0

3 检查输出和实际结果#

squeue -u "$USER"
tail -n 30 stdout.log
ls OUT.*

确认正常结束后,再检查电子收敛、几何或时间步终止条件以及本篇需要的结果文件。SCF电子收敛不等于晶胞或原子优化完成。

实算目录 最后总能量 / eV 计算类型 执行路径
official-stochastic-pw_Si2 -300.004344985 scf GPU

总能量是整个输入晶胞的量;不同原子数、赝势、泛函或物理条件的数值不能直接相减。CPU路径也在分配的计算资源中执行,本表不提供CPU节点性能对照。

4 提取和重画#

回到资料包根目录:

module load ase/3.29.0
python plot.py stochastic
ls figures

plot.py读取对应原始日志或结果文件;已有CSV在 analysis。结构可打开输出的 STRU.cif,cube可在VESTA查看。保留原始数据、坐标单位和参数,修改绘图不能改变计算结果。

进一步查阅#

需要根据你的体系选择资源?联系讨论计算需求。实际可用软件与权限,以当前账户和运行环境为准。

查看配图

放大后可滚动查看细节,按 Esc 关闭。

100%查看原图 ↗