LAMMPS 实操教程与实例
建模、势函数、平衡、续算、结构分析、力学、热输运和GPU操作的真实算例。
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这一专题围绕普通用户的实际任务组织：先准备结构和相互作用，再优化、平衡、采样，最后提取和绘图。新增 34 个真实计算目录、28 张结构与数据图，配套 Atomsk、ASE、OVITO 的实际操作。原有 GPU 包/KOKKOS、性能、精度、显存与参数指南继续保留。
本文使用鸢算科技集群 LAMMPS 30 Sep 2026 的真实计算。下载输入、参考轨迹、分析脚本与数据图（约 72.5 MB），解压后进入 lammps-examples。cases 保存参考结果，inputs 保存干净输入，使用 new-case.py 创建自己的计算副本。
第一次使用#
unzip lammps-examples-*.zip
cd lammps-examples
python new-case.py lj-T1.0
cd work/lj-T1.0
sbatch run.sh
Windows用户可以直接解压后上传目录；先阅读环境与任务提交，确认自己的资源与账户类型。文件下载后的实际名称带内容哈希，通配命令需要在只放这份附件的目录执行。
按任务阅读#
| 文档 | 你可以完成什么 |
|---|---|
| LAMMPS 环境与任务提交 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 从零跑通第一个算例 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 建立结构、区域与原子组 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 选择势函数与单位 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 原子位置与晶胞优化 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 能量体积曲线与平衡晶格 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS NVE、NVT、NPT与随机控温 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 时间步长与能量漂移 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 镍晶体的平衡与温度扫描 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS Tersoff硅与多体势 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS SPC/E水、长程静电与SHAKE | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 珠簧聚合物与回转半径 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 保存检查点与继续计算 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 用已有轨迹重新计算能量 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 径向分布函数与配位数 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 均方位移与扩散系数 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 速度自相关与动力学分析 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 应变应力与弹性常数 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 空位结构与局部环境 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS Green–Kubo热输运 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 反向非平衡热输运 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 压力相关函数与黏度 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS PLUMED集体变量与偏置 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS GPU包与KOKKOS实操对照 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 配套工具实操 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 通用命令索引 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 势函数与拓扑样式 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS 积分、控温与fix样式 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
| LAMMPS compute、输出与其他样式 | 从终端输入到实际结果，按本篇步骤操作 |
原有GPU专题#
如何理解这些实例#
静态晶体、LJ流体、SPC/E水、珠簧链都来自本任务自建模型，没有使用客户私有数据。GPU包采用mixed精度，KOKKOS采用独立构建。短轨迹结果用来指导操作，不自动代表收敛材料性质。实际运行、样式可用性和专项参考在文中分别说明。CPU节点数据本批未新增，V10032G未使用。
把模型换成自己的研究体系时，要重新核对势函数、边界、原子类型、单位、平衡时间与统计误差。先让小体系的物理设定正确，再扩大规模。
需要根据你的体系选择资源？联系讨论计算需求。实际可用软件与权限，以当前账户和运行环境为准。