ABACUS 专题

ABACUS 电荷混合、占据与电子温度

电荷混合、占据与电子温度:终端操作、完整输入、真实结果与适用范围。

更新于 2026-10-27约 5 分钟阅读按任务与环境选择适用配置
阅读本篇目录

本篇采用鸢算科技集群 ABACUS 3.10.1 的实际输入与输出。下载实操资料包,解压后进入 abacus-examples。inputs 是干净输入,cases 是参考结果,work 用于你的新计算。

这篇要做什么#

对相同Si结构演示电荷混合、展宽、固定占据和电子数设置。plain、pulay、broyden是迭代算法选择;Gaussian、Fermi–Dirac、Methfessel–Paxton展宽不完全等价。smearing_sigma与xc_temperature均应按手册核对Ry单位,不能直接填写摄氏温度。带电周期晶胞需要背景/补偿模型和有限尺寸检查,本例只演示电子数入口,不把总能量差当成缺陷形成能。固定占据数组按k点与能带数量匹配,Gamma示例的8个数不能直接用于多k点。

1 准备并提交#

python new-case.py mixing-plain
cd work/mixing-plain
sbatch run.sh

提交脚本使用核时分区模板。套餐用户按自己的资源权限用 yskit 生成提交脚本,保留相同的 ABACUS 计算命令。不要在登录节点直接运行计算。

本篇资料目录:mixing-plain、mixing-pulay、mixing-broyden、smearing-gaussian、smearing-fd、smearing-mp、finite-temperature-xc、charged-cell、fixed-occupations。其他对照例回到资料包根目录,换目录名后用同样三个命令提交。

2 核心输入#

mixing-plain/INPUT 的完整内容:

INPUT_PARAMETERS
suffix tutorial
calculation scf
basis_type pw
ecutwfc 40
scf_thr 1e-8
scf_nmax 150
ks_solver cg
device gpu
precision double
cal_force 1
cal_stress 1
pseudo_dir ../../PP_ORB
orbital_dir ../../PP_ORB
mixing_type plain
mixing_beta 0.4

重点检查:mixing_type、mixing_beta、smearing_method、smearing_sigma、ocp_set、nelec、xc_temperature。参数与说明应按3.10.1理解;官网 latest 的新增参数见版本与扩展范围。

展开完整 STRU 结构与 KPT 采样文件

STRU#

ATOMIC_SPECIES
Si 28.0855 Si_ONCV_PBE-1.0.upf

NUMERICAL_ORBITAL
Si_gga_8au_100Ry_2s2p1d.orb

LATTICE_CONSTANT
10.26

LATTICE_VECTORS
0 0.5 0.5
0.5 0 0.5
0.5 0.5 0

ATOMIC_POSITIONS
Direct
Si
0.0
2
0 0 0 1 1 1
0.25 0.25 0.25 1 1 1

KPT#

K_POINTS
0
Gamma
2 2 2 0 0 0

对照输入的差别#

mixing-pulay:

mixing_type pulay

mixing-broyden:

mixing_type broyden

smearing-gaussian:

smearing_method gaussian
smearing_sigma 0.01

smearing-fd:

smearing_method fd
smearing_sigma 0.01

smearing-mp:

smearing_method mp
smearing_sigma 0.01

finite-temperature-xc:

dft_functional LDA_XC_CORRKSDT
xc_temperature 0.01

charged-cell:

nelec 8.1
smearing_method fd
smearing_sigma 0.01

fixed-occupations:

out_chg 1
out_pot 1
out_wfc_pw 1
ocp 1
ocp_set 2 2 2 2 0 0 0 0
nbands 8

3 检查输出和实际结果#

squeue -u "$USER"
tail -n 30 stdout.log
ls OUT.*

确认正常结束后,再检查电子收敛、几何或时间步终止条件以及本篇需要的结果文件。SCF电子收敛不等于晶胞或原子优化完成。

实算目录 最后总能量 / eV 计算类型 执行路径
mixing-plain -211.920965786 scf GPU
mixing-pulay -211.920965746 scf GPU
mixing-broyden -211.920965746 scf GPU
smearing-gaussian -211.918706808 scf GPU
smearing-fd -211.949347327 scf GPU
smearing-mp -211.915683729 scf GPU
finite-temperature-xc -211.465730715 scf GPU
charged-cell -211.277010853 scf GPU
fixed-occupations -197.524341646 scf GPU

总能量是整个输入晶胞的量;不同原子数、赝势、泛函或物理条件的数值不能直接相减。CPU路径也在分配的计算资源中执行,本表不提供CPU节点性能对照。

4 提取和重画#

回到资料包根目录:

module load ase/3.29.0
python plot.py scf-controls
ls figures

plot.py读取对应原始日志或结果文件;已有CSV在 analysis。结构可打开输出的 STRU.cif,cube可在VESTA查看。保留原始数据、坐标单位和参数,修改绘图不能改变计算结果。

进一步查阅#

需要根据你的体系选择资源?联系讨论计算需求。实际可用软件与权限,以当前账户和运行环境为准。

查看配图

放大后可滚动查看细节,按 Esc 关闭。

100%查看原图 ↗