ABACUS NiO的DFT+U
NiO的DFT+U:终端操作、完整输入、真实结果与适用范围。
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本篇采用鸢算科技集群 ABACUS 3.10.1 的实际输入与输出。下载实操资料包,解压后进入 abacus-examples。inputs 是干净输入,cases 是参考结果,work 用于你的新计算。
这篇要做什么#
NiO示例用不同Ni类型给出反铁磁初值。orbital_corr指定每种原子类型需要修正的角动量通道,2对应d轨道,-1表示不施加U;hubbard_u按同样类型顺序填写。本例U=5 eV用于工作流演示,不应直接搬到其他元素、轨道或赝势组合。
1 准备并提交#
python new-case.py official-dft_plus_u-NiO
cd work/official-dft_plus_u-NiO
sbatch run.sh
提交脚本使用核时分区模板。套餐用户按自己的资源权限用 yskit 生成提交脚本,保留相同的 ABACUS 计算命令。不要在登录节点直接运行计算。
本篇资料目录:official-dft_plus_u-NiO。其他对照例回到资料包根目录,换目录名后用同样三个命令提交。
2 核心输入#
official-dft_plus_u-NiO/INPUT 的完整内容:
INPUT_PARAMETERS
suffix NiO
ntype 3
nbands 40
pseudo_dir ../../PP_ORB
orbital_dir ../../PP_ORB
calculation scf
ecutwfc 100
scf_thr 1.0e-6
scf_nmax 150
smearing_method gaussian
smearing_sigma 0.015
mixing_type broyden
mixing_beta 0.4
ks_solver elpa
basis_type lcao
gamma_only 0
symmetry 0
nspin 2
dft_plus_u 1
orbital_corr 2 2 -1
hubbard_u 5.0 5.0 0.0
out_bandgap 1
out_chg 1
out_mul 1
device gpu
重点检查:dft_plus_u、orbital_corr、hubbard_u、nspin。参数与说明应按3.10.1理解;官网 latest 的新增参数见版本与扩展范围。
展开完整 STRU 结构与 KPT 采样文件
STRU#
ATOMIC_SPECIES
Ni1 58.693 Ni_ONCV_PBE-1.0.upf
Ni2 58.693 Ni_ONCV_PBE-1.0.upf
O 15.999 O_ONCV_PBE-1.0.upf
NUMERICAL_ORBITAL
Ni_gga_9au_100Ry_4s2p2d1f.orb
Ni_gga_9au_100Ry_4s2p2d1f.orb
O_gga_7au_100Ry_2s2p1d.orb
LATTICE_CONSTANT
7.884
LATTICE_VECTORS
1.00 0.50 0.50
0.50 1.00 0.50
0.50 0.50 1.00
ATOMIC_POSITIONS
Direct
Ni1
2.0
1
0.00 0.00 0.00 1 1 1
Ni2
-2.0
1
0.50 0.50 0.50 1 1 1
O
0.0
2
0.25 0.25 0.25 1 1 1
0.75 0.75 0.75 1 1 1
KPT#
K_POINTS
0
Gamma
7 7 7 0.0 0.0 0.0
### If you are running an energy calculation, please make sure your final energy is
### converged with respect to the k-point settings, unless you set a loose k-point
### mesh on purpose.
3 检查输出和实际结果#
squeue -u "$USER"
tail -n 30 stdout.log
ls OUT.*
确认正常结束后,再检查电子收敛、几何或时间步终止条件以及本篇需要的结果文件。SCF电子收敛不等于晶胞或原子优化完成。
| 实算目录 | 最后总能量 / eV | 计算类型 | 执行路径 |
|---|---|---|---|
official-dft_plus_u-NiO |
-9253.285176932 | scf |
GPU |
总能量是整个输入晶胞的量;不同原子数、赝势、泛函或物理条件的数值不能直接相减。CPU路径也在分配的计算资源中执行,本表不提供CPU节点性能对照。

4 提取和重画#
回到资料包根目录:
module load ase/3.29.0
python plot.py dft-u
ls figures
plot.py读取对应原始日志或结果文件;已有CSV在 analysis。结构可打开输出的 STRU.cif,cube可在VESTA查看。保留原始数据、坐标单位和参数,修改绘图不能改变计算结果。
进一步查阅#
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