LAMMPS构建与功能边界

这份导航使用鸢算科技集群LAMMPS30Sep2026的P100 GPU与KOKKOS模块帮助，以及已有公开输入和成功原生运行记录。它保留了完整样式名称、构建范围和可参考的案例入口。

下载样式CSV/JSON、检索脚本和构建对照：

mkdir style-guide
cd style-guide
curl -fL https://yuansuan.top/assets/downloads/full-function/lammps-style-index-wave85-cba0ef4fb4f0.zip -o examples.zip
unzip examples.zip
module purge
module load ase/3.29.0

索引工具处理现有文本和数据，不启动分子动力学。可直接查询已附的analysis/styles.json，也可重建索引：

python rebuild_index.py
python find_style.py pod
python plot_index.py

重建会刷新这份解压副本中的analysis目录和reference/figures；案例的原生输入、轨迹和参数仍从对应教程资料包获取。

1 GPU与KOKKOS是构建标签#

清单中的GPU表示 lammps/30Sep2026-p100-gpu 基础构建包含该名称；KOKKOS表示 lammps/30Sep2026-p100-kokkos 包含它。基础名称出现在GPU构建中，不表示该计算自动在GPU执行。

模型精度与程序性能分开阅读：CPU/P100单点一致性不等于任何体系都能得到同样加速比。当前清单来自上述P100模块；换其他模块或GPU架构时，读取对应帮助并使用该模块已给出的具体案例。

2 在自己的模块中查看#

在已分配的计算资源里：

module purge
module load lammps/30Sep2026-p100-gpu
lmp -h > module-help.txt
sed -n '/Installed packages:/,/Lists of individual/p' module-help.txt

帮助清单按构建导出。附件styles-GPU.txt与styles-KOKKOS.txt保存了用于本索引的包/样式部分；用相同名称的两份清单即可重建检索数据。

python find_style.py pair lj/cut/gpu
python find_style.py pair pod/kk
python find_style.py command geturl

3 识别入口与实际依赖不同#

包内check_module.in使用已知注册入口与feature查询，输入如下：

print "FEATURE curl $(is_available(feature,curl):%.0f)"
print "COMMANDSTYLE geturl $(is_available(command,geturl):%.0f)"
print "COMMANDSTYLE kim_init $(is_available(command,kim_init):%.0f)"
print "PAIRSTYLE lj/cut $(is_available(pair,lj/cut):%.0f)"
print "COMPUTESTYLE fep $(is_available(compute,fep):%.0f)"
print "MINSTYLE spin/lbfgs $(is_available(minimize,spin/lbfgs):%.0f)"

在已分配的计算资源中执行：

module purge
module load lammps/30Sep2026-p100-gpu
lmp -in check_module.in

这只查询模块功能，没有创建原子或运行模拟。两个基础构建的实测均返回：

FEATURE curl 0
COMMANDSTYLE geturl 1
COMMANDSTYLE kim_init 1
PAIRSTYLE lj/cut 1
COMPUTESTYLE fep 1
MINSTYLE spin/lbfgs 1

geturl样式入口存在，但curl功能为0，因此这个模块不能直接用内置geturl下载。可以在提交前用终端curl准备文件，再把本地文件路径交给输入脚本。

kim_init是命令分派内部样式名；官方输入使用 kim init 等子命令语法。入口存在与KIM API、所选模型已经安装是不同条件。

4 五类命令的环境要求#

以下针对这两个P100基础构建，其他专用模块应按各自帮助与教程读取。

这五项保留在官方通用命令导航中，但不标为已有成功计算示例。Python读取CSV、ASE处理结构与LAMMPS内部python命令各有环境入口，不能混淆。

5 114条命令与54条Command样式的口径#

114来自官方通用命令索引；54是当前帮助里Command样式这一类的名称数。部分内核入口不按同一表列出，部分内部子命令又有独立样式名，因此不要用54代替全部输入命令数。

本组教程已有109条通用命令的成功参考，环境条件与具体支持边界仍应逐项读取。查操作从 通用命令参考 开始，查样式从 样式与实例导航 开始。

原生说明：geturl、OpenKIM命令、MDI、Fenix。