SPPARKS专题

SPPARKS 实操专题

从Ising、晶粒长大到扩散、反应、沉积与烧结，按模型阅读命令、真实轨迹和结果。

更新于 2026-10-30约 3 分钟阅读按任务与环境选择适用配置

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下载SPPARKS实操包。包内含78个真实计算条件、原始输入/轨迹/统计、独立提取脚本和11张结构与数据图。每篇建议从新的解压目录开始；已经完整计算过的目录不要再次执行同名条件，以免混入旧结果。

SPPARKS适合事件驱动的动力学Monte Carlo（KMC）和拒绝式Monte Carlo（rKMC）。它解决的是离散状态和跃迁事件的演化；建模时首先确定“站点存什么、允许什么事件、事件速率是什么”，再选求解器。

1. 环境与资源#

module purge
module load spparks/08Oct25-8173m
which spparks
spparks -h

当前使用08Oct25 CPU版、Intel oneAPI 2024.2与Intel MPI工具链。示例用原生可执行程序，不需要GPU。8173m是集群的构建入口名称，实际还须使用兼容该二进制指令集的CPU资源。程序版本和完整来源随包保存。

较长计算在申请到的CPU资源内执行。包内 run.slurm 按CPU分区整节点规则请求56核，示例实际最多同时4个MPI进程、每进程1线程；这套输入用于教学，没有把请求核数当成实际加速比。分区暂时没有可用资源时等待调度或联系管理员安排资源。

只从已有原始数据重新提取、画图：

bash analyze.sh
ls analysis-reference
ls figures-reference

另一份新解压目录中，提交整套工作流：

sbatch run.slurm

也可以在已经分配好的CPU资源内执行 bash run-all.sh。整套78条件串行排列，每次最多4MPI；analysis/保存CSV和数值，figures/保存高清图。下载包中的原始参考始终在 reference/。

基础包示范6个app样式，沉积是diffusion的另一条工作流；下面的扩展包补充另外20个家族。两包合计124个原生条件（含ID初始化复核），使已注册26个app均有实际操作示例。各包单独解压，不能将两个包的同名脚本混放；逐app覆盖不代表所有参数分支或材料均已计算。

相关入口：SPPARKS专题、官方文档、08Oct25源码版本。本专题使用有限小模型解释操作和输出，不把这些数字当作已收敛材料参数。