Gaussian 专题

Gaussian 工具与文件处理入口

区分主程序、实跑辅助工具、开发支持入口和内部Link,按文件类型选择实际命令。

更新于 2026-11-05约 4 分钟阅读按任务与环境选择适用配置
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1. 先从要处理的文件选择工具#

Gaussian程序目录包含主驱动、辅助工具、编译/开发支持程序和内部Link。**目录中能执行的文件不全是供用户逐个调用的命令。**本页列出本次C.01目录的30个非Link入口;另外85个l数字.exe由Gaussian路线自动调度,不作为85个独立终端功能宣传。

以下工具的实跑命令与原始数值已经分别放在既有教程中。个人Gaussian初始化后先检查路径:

yskit gaussian-init
command -v g16
command -v formchk
command -v cubegen
文件或目标 使用工具 实操教程
GJF输入→计算日志与CHK g16 输入/续算
CHK→可读FCHK formchk 检查点工具
FCHK→本机二进制CHK unfchk 检查点工具
检查已有CHK chkchk 检查点工具
几何格式转换 newzmat 检查点工具
检查输入路线 testrt 检查点工具
FCHK→密度/轨道/势cube cubegen 密度与网格、NTO
cube组合、比较与向量分量 cubman 标量cube、向量cube
已有频率资料→新温压/同位素 freqchk freqchk

2. 最常用的一条处理链#

在已分配的资源中,用本批水分子PM6例子:

bash compute.sh water-pm6
ls work/water-pm6

脚本已实际调用g16和formchk。要手动看原生文件:

cd work/water-pm6
tail -n 1 output.log
head -n 12 result.fchk

单独转换自己的检查点时:

formchk result.chk result.fchk
chkchk result.chk

本批默认绘图不需要复制CHK/FCHK给网站,也不需要把完整轨道系数上传到公共目录。密度/轨道cube、cubman的交互回答和freqchk的温压步骤按上表专门教程操作;不能把所有FCHK的Total Energy字段都当作目标结果。

3. 其余21个非Link入口#

这些名称确实存在于本次目录,存在不等于本专题提供了一个通用命令行配方。下面逐项保留名称和使用前提,避免把低层接口编造成普通客户的计算命令。

入口 面向用户的使用范围
c8616 属于该发行包的辅助/开发支持入口;先查本版本配套说明及所需专用输入,不在普通GJF运行链里直接调用。
copychk 属于该发行包的辅助/开发支持入口;先查本版本配套说明及所需专用输入,不在普通GJF运行链里直接调用。
demofc 低层文件/矩阵或专门接口流程;需明确文件格式、记录编号或驱动约定,不能把随机CHK/RWF当作输入试跑。
freqmem 属于该发行包的辅助/开发支持入口;先查本版本配套说明及所需专用输入,不在普通GJF运行链里直接调用。
gau-cpp 构建/开发支持相关;预编译C.01用户不需要靠它重新编译Gaussian,编译器信息也不能据此猜测。
gau-fsplit 构建/开发支持相关;预编译C.01用户不需要靠它重新编译Gaussian,编译器信息也不能据此猜测。
gau-machine 构建/开发支持相关;预编译C.01用户不需要靠它重新编译Gaussian,编译器信息也不能据此猜测。
gauopt 构建/开发支持相关;预编译C.01用户不需要靠它重新编译Gaussian,编译器信息也不能据此猜测。
gauoptl 构建/开发支持相关;预编译C.01用户不需要靠它重新编译Gaussian,编译器信息也不能据此猜测。
gautraj 轨迹相关专门入口;本专题BOMD/ADMP实际采用日志数值与ASE生成XYZ/TRAJ,不能把这些名称当作通用VASP/LAMMPS轨迹转换器。
gdrgen 属于该发行包的辅助/开发支持入口;先查本版本配套说明及所需专用输入,不在普通GJF运行链里直接调用。
ghelp 属于该发行包的辅助/开发支持入口;先查本版本配套说明及所需专用输入,不在普通GJF运行链里直接调用。
grate 属于该发行包的辅助/开发支持入口;先查本版本配套说明及所需专用输入,不在普通GJF运行链里直接调用。
ham506 低层文件/矩阵或专门接口流程;需明确文件格式、记录编号或驱动约定,不能把随机CHK/RWF当作输入试跑。
mm 属于该发行包的辅助/开发支持入口;先查本版本配套说明及所需专用输入,不在普通GJF运行链里直接调用。
pluck 属于该发行包的辅助/开发支持入口;先查本版本配套说明及所需专用输入,不在普通GJF运行链里直接调用。
rdmat 低层文件/矩阵或专门接口流程;需明确文件格式、记录编号或驱动约定,不能把随机CHK/RWF当作输入试跑。
rwfdump 低层文件/矩阵或专门接口流程;需明确文件格式、记录编号或驱动约定,不能把随机CHK/RWF当作输入试跑。
solname 属于该发行包的辅助/开发支持入口;先查本版本配套说明及所需专用输入,不在普通GJF运行链里直接调用。
trajgen 轨迹相关专门入口;本专题BOMD/ADMP实际采用日志数值与ASE生成XYZ/TRAJ,不能把这些名称当作通用VASP/LAMMPS轨迹转换器。
wrmat 低层文件/矩阵或专门接口流程;需明确文件格式、记录编号或驱动约定,不能把随机CHK/RWF当作输入试跑。

4. 常见选择错误#

Guess=Huckel是轨道猜测,Huckel是另一种模型;两者区别见Huckel与ZINDO。formchk只转换数据,不替你完成优化、频率或极点计算。程序内部Link不直接提交;正常路线从g16 < input.gjf > output.log开始。

完整程序与许可由用户自己的授权安装提供,下载资料包只包含自有输入、选定数值和绘图脚本。功能家族索引用于判断计算方法是否符合目标任务。

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