VTST:双重nudging的开关与力分量
比较LDNEB与LDNEBORG实际附加力,区分单步算法演示和收敛能垒。
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双重nudging会在普通NEB路径力之外加入修正,处理垂直弹簧力等分量。本例沿用Al表面弯曲路径的结构和完整输入,只改变力算法开关。
下载输入、四组实际输出及读取绘图脚本,保存为 example.zip:
python3 -m zipfile -e example.zip .
cd vtst-NEB-force-variants
bash read.sh
bash plot.sh
默认读取随包真实结果。软件为VASP 6.6.1 CPU VTST构建,Intel oneAPI运行环境,模块 vasp/6.6.1-8173m-vtst。读取使用ASE和NumPy,绘图使用Matplotlib。
1. 四组开关怎样设#
| 目录 | LTANGENTOLD | LDNEB | LDNEBORG |
|---|---|---|---|
| improved | FALSE | FALSE | FALSE |
| old-tangent | TRUE | FALSE | FALSE |
| DNEB | FALSE | TRUE | FALSE |
| original-DNEB | FALSE | TRUE | TRUE |
for name in improved old-tangent DNEB original-DNEB; do
echo "$name"
cat inputs/"$name"/INCAR
done
使用双重nudging时保留其余电子、几何、约束和弹簧设置一致,才容易判断差别来自哪里。
2. 实际力差别#

平滑形式的双重nudging附加力整体范数约 0.0263995032 eV/Å,原始形式约 4.0113548683 eV/Å。这两个数是全体可动分量的修正范数,不是单原子最大力。对应可动原子最终投影力最大值约 0.899344 和 3.625015 eV/Å。
同一结构上不同算法给出的力可能差别很大;这不表示电子结构计算发生变化。四组实际电子自由能均为 -42.26525156 eV。配套脚本分别重建切线、平行弹簧力、垂直真实力及双重修正,按原生输出精度比较。
3. 运行与读取#
python3 prepare.py
cp /你的势目录/Al/POTCAR work-new/POTCAR
cd work-new
sbatch ../submit.sh
# 等作业结束
cd ..
bash read.sh work-new
bash plot.sh
head analysis-read/VTST-NEB-force-variants.csv
每组实际使用2个MPI进程、OMP线程1;提交模板申请56核整节点。模板顺序跑完四组,分别保存原生OUTCAR及退出信息。
这是一套单步力算法实例,没有比较哪种算法在所有材料上更快,也没有完成该弯曲路径的几何优化。CSV数据可用于核对图中数字。实际做NEB时先用普通设置建立稳定路径,再根据路径弯曲、弹簧力及优化表现决定是否采用这些选项。
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